Фамилия Мацухова образована от имени-основы Мацухо — народной, обиходной формы крестильного имени Матвей. В переводе с древнееврейского оно означает «дарованный Богом», а на Руси имя получило широкое хождение после прославления Матфея Новоторжского, которого почитают как одного из первых иноков-подвижников на русской земле. Именно эта церковная традиция и закрепила имя в повседневном обиходе, где оно быстро обрастало уменьшительными и просторечными вариантами.

Суффикс -их- в основе указывает на притяжательное значение: Мацухо — это «сын Матвея» или «человек из рода Матвея». Сама форма Мацухо — результат типичного для народной речи смягчения и перестановки звуков: от Матюха через Мацуха к Мацухо. Такие переходы не редкость в русской ономастике, особенно в северных и центральных говорах, где конечное -о в прозвищах и именах встречалось часто.

Скорее всего, основатель рода Мацуховых принадлежал к простому сословию — крестьянам или посадским людям. Фамилии на -ов/-ев в этой среде закреплялись позже, чем у дворянства, и часто фиксировали не профессию, а личное имя отца. Поэтому потомки человека по имени Мацухо со временем и получили фамилию Мацухов, а женская форма Мацухова — это лишь грамматическое указание на принадлежность к этому роду.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную основу, которая сегодня почти не встречается как самостоятельное имя. Это делает её ценным свидетельством живой народной традиции имянаречения, где каноническое церковное имя переплавлялось в домашнее, тёплое и узнаваемое. В письменных источниках фамилия редкая, что говорит о локальном бытовании — возможно, род происходил из одного села или волости, где прозвище Мацухо закрепилось за конкретной семьёй.