Фамилия Макухова — женская форма от Макухов, и её происхождение почти наверняка связано с прозвищем или мирским именем Макух. В русских говорах «макуха» — это жмых, то есть отходы после выжимки масла из семян подсолнечника, льна или конопли. Прозвище Макуха могли дать либо человеку, который занимался производством или продажей растительного масла, либо, в переносном смысле, тому, кто «выжимал» из дела последнюю выгоду, был прижимистым и хозяйственным. Реже, но возможно, что в основе лежит украинское или южнорусское «макуха» — головка мака, но такое значение менее вероятно для прозвища.

Суффикс -ов в фамилии Макухов (а затем и Макухова) указывает на типичную модель русских фамилий-притяжательных прилагательных, отвечающих на вопрос «чей?». То есть Макухов буквально значило «сын Макуха» или «человек из семьи Макуха». Фамилия не относится к числу дворянских или книжных — она бытовала в крестьянской и мещанской среде, особенно в регионах, где было развито маслобойное дело: на юге России, в Поволжье, на Украине. Встречаются и однокоренные фамилии — Макухин (с суффиксом -ин, по другой модели), Макушенко (украинская форма), что подтверждает народный, а не искусственный характер происхождения.

Интересно, что фамилия Макухова нередко фиксируется в старых метрических книгах с вариантами написания: Макухова, реже Макухова с ударением на первый слог. Учитывая, что слово «макуха» в русском языке имеет устойчивое ударение на второй слог, фамилия, скорее всего, произносилась как Макухова, хотя в разных местностях ударение могло смещаться. В целом, это редкая, но выразительная фамилия, сохранившая память о бытовом ремесле и народной наблюдательности.