Фамилия Матыскина образована от имени Матыска — народной, обиходной формы крестильного имени Матвей (в церковной традиции — Матфей). В переводе с древнееврейского это имя означает «дарованный богом» (или «дар Яхве»), и в этом смысле фамилия восходит к библейской традиции: апостол Матфей, один из двенадцати учеников Христа, считается автором первого Евангелия.

Имя Матыска возникло в разговорной среде, где полные церковные формы часто сокращали и переделывали на свой лад. Подобные варианты — Матя, Матюха, Матюша, Матыска — бытовали в крестьянской и посадской среде. Суффикс -ск- в данном случае не указывает на географическое происхождение (как в фамилиях типа Вяземский), а выполняет иную роль: он участвует в образовании просторечной формы имени, придавая ей оттенок фамильярности или ласковости. Такая модель не редкость: ср. уменьшительные имена вроде Васька, Мишка, но с другим суффиксом.

Фамилия Матыскин (и её женская форма Матыскина) закрепилась по обычной для русских фамилий схеме: от имени отца или главы семьи. Если человека звали Матыска, то его дети и домочадцы получали прозвание «Матыскины дети», которое со временем превратилось в наследственную фамилию. Это указывает на то, что основатель рода был человеком простого звания — крестьянином, ремесленником или мелким служилым человеком, — поскольку в дворянской среде такие обиходные формы имён в фамилии почти не попадали.

Интересно, что фамилия сохранила именно просторечную основу, а не книжную форму «Матвеев». Это делает её характерным памятником живой народной речи: в ней слышится то, как имя звучало в повседневном общении, а не в церковных записях. По той же модели возникли фамилии Матыкин, Матысов, Матыцин, но Матыскин отличается суффиксом -ин, который в русской ономастике чаще всего указывает на принадлежность конкретному лицу: «чей?» — Матыскин, то есть сын или потомок Матыски.

Точных сведений о географии фамилии в открытых источниках мало, но по характеру образования она скорее всего встречается в центральных и северных русских областях, где были распространены подобные разговорные формы имён. Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких локальных родов, а не из широкого рассеянного ареала.

Таким образом, за фамилией Матыскина стоит не прозвище и не профессия, а личное имя предка. Расшифровка проста: человек по имени Матыска, живший несколько столетий назад, дал начало роду, который мы знаем сегодня.