Имя Матюша является уменьшительной формой крестильного мужского имени Матвей (в переводе с древнееврейского – «человек Божий»). Скорее всего, основатель рода Матюшенковых был выходцем из простого сословия. Суффикс -енко указывает на то, что фамилия Матюшенкова сложилась на Восточной Украине. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Матюша, со временем получил фамилию Матюшенкова.