Фамилия Маутен — редкий случай, когда иноязычная основа почти не изменилась при переносе в русскую среду. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин или -ский, Маутен лишён типичного фамильного суффикса. Это указывает на то, что фамилия либо была заимствована в готовом виде, либо образована по модели, не свойственной славянской ономастике.

Скорее всего, перед нами фамилия немецкого или австрийского происхождения. В немецком языке «Mauten» — форма множественного числа от слова «Maut» (пошлина, мыто). Так могли называть сборщиков дорожных или мостовых пошлин, либо людей, живших рядом с заставой, где взимали плату за проезд. Географически фамилия тяготеет к южным немецким землям (Бавария, Австрия) и к историческим регионам расселения немцев в Российской империи — Поволжью, Причерноморью, Волыни.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: Маутен — это русифицированная запись еврейской фамилии. В идише «маутен» может означать «подать» или «налог», что отсылает к той же профессиональной сфере. Однако для еврейских фамилий более характерны окончания -ман, -берг, -штейн, поэтому немецкое происхождение выглядит убедительнее.

Написание фамилии могло колебаться: в документах XIX века встречаются варианты Маутен, Маутэн, а также Мауттен (с удвоенной «т»). В России носители фамилии чаще всего оказывались потомками колонистов, приглашённых Екатериной II, и занимались сельским хозяйством или ремеслом. Сословно это были мещане или крестьяне, реже — купцы. Фамилия остаётся редкой и сегодня, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы Маутен, ваши предки с высокой вероятностью были немецкими переселенцами, связанными с податной службой или жившими у заставы.