Фамилия Мавлетчина — редкий случай, когда суффикс выдаёт происхождение почти безошибочно. Окончание «-ина» указывает на притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?». В русской модели образования фамилий это форма женского рода, но закрепилась она за мужчиной: в большинстве случаев фамилии на «-ин» в чистом виде (Мавлетчин, Кузьмин) получали от имени или прозвища отца, а форма Мавлетчина могла закрепиться либо через материнскую линию (если мать звали Мавлетча), либо, что вероятнее для XIX века, как вариант бытового произношения, когда окончание не меняли при переписи. Встречается и написание Мавлетченко, но оно уже украинского или южнорусского образца.

Основа фамилии — личное имя Мавлетча, которое восходит к арабскому «Мавлет» (араб. موليت) — производному от «мауля» (господин, владыка, покровитель). В тюркской среде, особенно у татар и башкир, имя Мавлет (Мавлют) было распространено как один из вариантов имени Мавля — в честь имама Али или как эпитет «близкий к Богу». Суффикс «-ча» в тюркских именах (ср. Алтынча, Бахтыча) часто придавал ласкательный или уменьшительный оттенок, то есть Мавлетча — «маленький Мавлет» или «Мавлет, сын такого-то».

Географически фамилия Мавлетчина — почти стопроцентный маркер татарского или башкирского происхождения. Основной ареал — юго-восток Татарстана, запад Башкортостана и прилегающие районы Оренбургской области. Встречается она редко, даже по сравнению с однокоренными Мавлетовым и Мавлютовым, что говорит о локальном бытовании: возможно, в одном селе или роду.

В сословном отношении носители фамилии, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам — основной массе нерусского населения Поволжья, платившей подать и не знавшей крепостного права. Дворянских родов с такой фамилией нет, что тоже косвенно подтверждает народное, «неслужилое» происхождение.

Стоит различать Мавлетчину и Мавлютчину: вторая фамилия — от той же основы, но с другим тюркским суффиксом «-чи», обозначающим род деятельности (ср. ямщик, бакшей). Мавлютчин мог быть «человеком Мавлюта» или «тем, кто служит при Мавлюте», а Мавлетчина — именно «дочь/жена Мавлетчи» — чисто семейное прозвание.