Фамилия Маймескулова — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает личное прозвище. Она явно образована от названия реки Маймескул (встречается вариант Маймескул) — небольшого притока в бассейне Енисея, протекающего в Хакасии и на юге Красноярского края. Суффикс -ов- в сочетании с окончанием -а указывает на стандартную русскую модель притяжательных фамилий: «чей?» — Маймескулов, то есть «человек с Маймескула». Женская форма Маймескулова закрепилась через жену или дочь.

Основа «Маймескул» не славянская, а тюркская. В хакасском и шорском языках «май» может означать «жир» или «масло», а «мес» (или «мес») — «медь», «кул» — «озеро» или «река». Дословно топоним часто переводят как «Масляное озеро» или «Медное озеро», что указывает либо на цвет воды, либо на природные ресурсы в этом месте. Таким образом, прозвище предка было не от профессии или внешности, а от места жительства: его называли «Маймескулов» — тот, кто пришёл с берегов реки Маймескул.

Фамилия почти не встречается за пределами Сибири. В дореволюционных переписях её носители — скорее всего, крестьяне или казаки, осваивавшие южно-сибирские земли в XVIII–XIX веках. Суффикс -ов типичен для русского дворянства и купечества, но в данном случае он лишь показывает, что фамилию оформляли по общерусскому образцу, а не по местному тюркскому (где было бы, например, просто «Маймескул»).

Сравните с однокоренными фамилиями: Маймескулов (мужская форма), Маймескульский (с суффиксом -ский, более книжный вариант) — но они ещё реже. Спорных версий тут нет: никакого личного имени «Маймескул» не существовало, а попытки вывести фамилию из тюркского «май» (май) и «мескул» (вид рыбы) — натяжка, так как в гидрониме чётко выделяется три части. Единственное, что можно добавить: ударение, скорее всего, падает на второй слог — Майме́скулова, хотя в бытовой речи нередко смещается на третий.