Фамилия Мелканян — яркий пример армянской модели фамилии, указывающей на происхождение от личного имени. Основа здесь — мужское имя Мелкон, которое в русской передаче часто звучит как Мелкум или Мелкон. У имени несколько версий происхождения. Самая распространённая связывает его с древнееврейским Малкиэль (מלכיאל) — «Бог мой — царь». В армянской среде имя могло также восходить к греческому Μελκών или к тюркскому «мелкум» (погибший, пропавший), но версия с библейским корнем считается основной.

Суффикс -ян (в диалектах -янц) — самый массовый в армянской ономастике, он заменяет русские -ов/-ев. В дословном переводе Мелканян значит «из рода Мелкона» или «принадлежащий Мелкону». Такие фамилии закрепились в среде ремесленников, крестьян и купцов Западной и Восточной Армении в XIX веке, когда армянская церковь и царская администрация начали фиксировать фамилии по отчеству.

Интересная деталь: в русских документах XIX — начала XX века эта фамилия могла записываться как Мелконян или Мелкунян — через «о» или «у» в корне. Вариант Мелканян с «а» — скорее всего, диалектный, характерный для носителей из определённых областей исторической Армении (например, из районов Вана или Муша). В современной Армении фамилия встречается реже, чем, скажем, Петросян или Арутюнян, но остаётся узнаваемой и однозначно указывает на армянские корни.

Если предки носителя фамилии жили в Российской империи, они могли быть переселенцами из Западной Армении после геноцида 1915 года или же из восточных областей, вошедших в состав России ещё в 1828 году. Род занятий по фамилии не определяется — Мелканян не ремесленная и не прозвищная, а чисто патронимическая, то есть «по отцу». Это значит, что среди предков могли быть и ремесленники, и земледельцы, и торговцы — фамилия не сужает круг.