Фамилия Мерейно — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если посмотреть на её окончание, сразу бросается в глаза, что оно нестандартно для русских фамилий. Типичные русские модели — это -ов/-ев, -ин, -ский, -их/-ых. Окончание -о в именительном падеже мужского рода (Мерейно) характерно для украинских фамилий, а также для белорусских и польских. Поэтому первое, что можно предположить: фамилия Мерейно пришла из западнорусских земель или имеет украинские корни.

Основа фамилии — «Мерей-». Самое вероятное объяснение — происхождение от прозвища или имени Мерей. В старых русских говорах и украинском языке слово «мерей» могло означать «мера», «предел», «граница». В таком случае прозвище Мерей давали человеку осмотрительному, знающему меру, или же тому, кто жил на границе владений, у межи. Суффикс -н- в основе (Мерей-н-о) — типичный для украинских фамилий, образующихся от прозвищ: он присоединяется к основе и добавляет значение принадлежности или свойства. Сочетание «Мерейно» буквально можно понять как «сын Мерея» или «человек из рода Мерея».

Менее распространённая, но возможная версия — связь с личным именем. В некоторых регионах «Мерей» могло быть формой крестильного имени (например, сокращением от Димитрий или Еремей). В таком случае фамилия Мерейно образована по той же модели, что и многие украинские фамилии на -но: от уменьшительной формы имени (ср. Гринь — Гринько, Лев — Левко). Если исходным было имя Еремей (Иеремия), то форма Мерей вполне естественна: отпадение начального гласного в разговорной речи — распространённое явление (ср. Егор — Гора, Ефим — Химка).

Фамилия Мерейно не относится к числу частых и не имеет широкой географии. Встречается она преимущественно на западе России, в Беларуси и на Украине. Сословной принадлежности по фамилии не определить: такую фамилию мог получить и крестьянин, и казак, и мещанин. В документах XVIII–XIX веков её носители, скорее всего, записаны как «Мерейно» или «Мерейна» (в женском роде), что характерно для украинской системы фамилий, где мужские и женские формы различаются окончанием.