Фамилия Мерклингер ведет свое начало от двух немецких слов: Merk – «метка, знак», «поручейник» и Linker – «компоновщик». Таким образом, это прозвище указывало на род занятий предка. Согласно другой версии, вторая часть фамилии восходит к слову linken – «обманывать».