Фамилия Михилочкина — женская форма, мужской вариант — Михилочкин. Она образовалась по той же модели, что и тысячи русских фамилий: от имени или прозвища через суффикс принадлежности -ин. В основе лежит прозвище или уменьшительное имя Михилочка, которое, в свою очередь, восходит к крестильному имени Михаил.

Здесь интересен не столько корень (Михаил — одно из самых распространенных имен на Руси), сколько суффикс -очк-. В русской ономастике это довольно редкий способ образования фамилий. Обычно от уменьшительных форм на -ка делали фамилии на -кин (Михайкин, Мишкин), а форма на -очка и, соответственно, -очкин встречается реже. Такие фамилии чаще бытовали в северных и центральных губерниях, где любили ласкательные варианты имен. Михилочка — не просто Миша, а Миша с оттенком нежности или, возможно, прозвище младшего члена семьи, которого так звали домашние.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа могла быть не от имени, а от прозвища по роду занятий. В некоторых говорах «михиль» или «михля» могли называть нерасторопного, медлительного человека. Но в данном случае суффикс -очк- указывает скорее на уменьшительно-ласкательную форму, чем на прозвище взрослого человека. Поэтому версия с производным от Михаила выглядит убедительнее.

С точки зрения социального состава, Михилочкины — это крестьянские или мещанские фамилии. Дворянские роды с таким окончанием практически не встречались, поскольку фамилии на -ин в высших слоях образовывали в основном от основ на -а, -я (Пушкин, Репин), а здесь мы видим простонародную ласкательную форму.

Сравните с однокоренными, но более частыми фамилиями: Михайлов, Михайлин, Мишин, Мишкин. Михилочкин стоит в этом ряду особняком именно из-за редкого суффикса, который сразу выдает семейную историю: предка звали не просто Миша, а именно Михилочка, и это имя закрепилось за родом.