Фамилия Михуто звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Её происхождение почти наверняка связано с белорусским или украинским языком, где суффикс -ут- (-ут-) является характерным словообразовательным элементом. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, модель на -ут- встречается реже и чаще всего указывает на западнорусские земли, а также на Польшу, откуда такие формы могли прийти в восточнославянские говоры.

В основе фамилии лежит имя Михута — народная, разговорная форма канонического имени Михаил. Уменьшительно-ласкательные суффиксы вроде -ут- (сравните: Михута, Данута, Янута) были распространены в старобелорусском и староукраинском языках. Таким образом, Михута — это «маленький Михаил», «Михайлушка». Фамилия образована бессуффиксным способом: прозвище или нецерковное имя Михута просто закрепилось за потомками, не обрастая дополнительными окончаниями. В русской традиции такие фамилии иногда русифицировали, добавляя -ов, но вариант Михуто (с окончанием -о) мог сохраниться как диалектная или документальная особенность.

С точки зрения истории, предок носителя фамилии Михуто — скорее всего, крестьянин или мещанин из современных Беларуси, Украины или западных областей России (Смоленщина, Брянщина). В этих краях имя Михута фиксируется в письменных источниках XVI–XVII веков как личное имя, а не прозвище. Например, в реестрах казаков или в метрических книгах можно встретить запись «Михута Иванов сын». Фамилия не дворянская и не относится к высшим сословиям — это типичная «народная» фамилия, возникшая в среде, где фамилии закрепились позже, чем у знати.

Любопытно, что фамилия Михуто могла писаться и как Михута, но окончание -о в русском языке могло закрепиться под влиянием местных говоров или при переносе в официальные документы (например, как форма родительного падежа, которая стала восприниматься как именительный: «чей? — Михуто»). В любом случае, значение одно: «потомок Михуты», то есть потомок человека по имени Михаил в его ласкательной форме.