Фамилия Микиденко — характерный пример восточнославянской модели фамилий на -енко, которая особенно распространена на Украине и в южных регионах России. В основе лежит имя Микида — это народно-разговорная форма крестильного имени Никита. В украинской и южнорусской традиции начальное «н» часто заменялось на «м»: Никита превращался в Микиту, а его уменьшительные формы — в Микиду или Микитку. Суффикс -енко в этих краях традиционно означал «сын» или «потомок», так что Микиденко — буквально «сын Микиды», то есть потомок человека по имени Микида.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна. От имени Микида с помощью патронимического суффикса -енко образована фамилия, указывающая на родство. Это типичная украинская фамилия, каких множество: Микитенко, Микитюк, Микитченко. Отличие Микиденко в том, что основа сокращена — взята не полная форма Микита, а более короткая Микида, что характерно для обиходной, домашней речи. Такое усечение часто встречалось в сёлах, где имена в быту звучали проще и короче.

Географически фамилия Микиденко привязана к левобережной Украине, особенно к Полтавской, Черниговской и Сумской областям, а также к приграничным районам России — Курской и Белгородской областям. В этих местах фамилии на -енко составляют основу местного ономастикона. В дореволюционных переписях носители Микиденко чаще всего числились казаками или крестьянами — сословная принадлежность здесь не уникальна, но показательна: фамилия не дворянская, а народная, возникшая в среде простых людей.

Интересная деталь: написание фамилии через «и» — Микиденко, а не через «е» (Мекеденко) — закрепилось именно из-за произношения имени Микита. В некоторых говорах звук «и» мог редуцироваться, но письменная форма оказалась устойчивой. Если встретите вариант Микиденко с ударением на второй слог, это не ошибка, а местная акцентологическая норма. В целом фамилия не редкая, но и не массовая — её носители обычно знают о своей украинской или южнорусской родословной, что делает её хорошим маркером регионального происхождения.