Фамилия Микумина звучит необычно, но её происхождение укладывается в простую и распространённую модель. Это женская форма фамилии Микумин, которая образована с помощью патронимического суффикса -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Микумин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Микума.

Самая вероятная основа — прозвище Микума. В русских говорах, особенно северных и сибирских, слово «микума» или «микумка» могло означать неловкого, неуклюжего или простоватого человека. В диалектах встречается глагол «микумить» — делать что-то неспешно, с запинкой или нелепо. Таким образом, прозвище могло закрепиться за человеком с медлительным или неловким характером. Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с финно-угорским субстратом: в некоторых прибалтийско-финских языках есть корни, означающие «тихий» или «скромный», что могло отразиться в прозвище на северо-западе России.

Географически фамилия Микумина встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Основные очаги — Вологодская, Архангельская и Кировская области, то есть регионы с сильным диалектным разнообразием и исторически оседлым населением. В отличие от фамилий на -ов, которые часто давались по мирским именам (Микула, Николай), Микумина стоит особняком: суффикс -ин здесь присоединён не к имени, а к прозвищу, что делает фамилию более «говорящей» о характере предка. Сословно носители, скорее всего, принадлежали к крестьянам или посадским людям — в дворянской среде такие прозвищные фамилии почти не встречались.