Фамилия Микутис — редкий для русского уха пример, который сразу выводит за пределы привычной восточнославянской модели. Её окончание -ис, а не -ов, -ин или -ский, указывает на литовское или латышское происхождение. В Литве и Латвии такие фамилии на -ис, -ус, -ас — норма, и образованы они чаще всего от кратких форм крестильных имён.

Основа Микут- восходит к уменьшительно-ласкательной форме от имени Микас, которое, в свою очередь, является литовским вариантом имени Михаил (лит. Mykolas). Суффикс -ут- (как в литовских Mikutis, Mikuta) служит для образования уменьшительных или фамильярных прозвищ, буквально — «маленький Микас» или «Микас-сынок». Таким образом, Микутис — это патронимическая фамилия: «сын или потомок Микутаса».

На территории бывшей Российской империи такие фамилии нередко русифицировали, меняя окончание на -ов (Микутов) или -ин (Микутин). Если вы встретили именно вариант Микутис, это почти наверняка указывает на сохранение исходной балтийской формы. В Беларуси и на северо-западе России (Псковская, Смоленская области) эта фамилия встречается в зоне исторического литовского влияния, где литвинские фамилии не переделывали на русский лад.

Интересная деталь: в литовском языке слово mikas может означать не только имя, но и «умелец», «ловкач», хотя в основе фамилии всё же лежит антропоним, а не прозвище по качеству. Спорных версий здесь нет — лингвисты сходятся на связи с именем Михаил через литовское посредничество. Социальный состав носителей разнообразен: от крестьян до мещан, так как эта модель фамилии была распространена во всех сословиях Великого княжества Литовского.