Основой фамилии Милеев послужило мирское имя Милей. Фамилия Милеев восходит к мирскому имени Милей. Также не исключено, что фамилия Милеев ведет свое начало от прозвища Милей, которое мог получить человек с кротким нравом, добродушный и незлобивый. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Милей, со временем получил фамилию Милеев.