Фамилия Миличенкова — женская форма, а её мужской вариант — Миличенков. В основе лежит имя или прозвище, и здесь сразу возникает вопрос: от какого именно? Самая прямая версия — от имени Миличенко, украинской или южнорусской формы имени Милий. Милий — это каноническое христианское имя, восходящее к латинскому «miles» (воин, солдат). В святцах оно встречается, но было редким, поэтому фамилия, образованная от него, тоже нечастая.

Суффикс «-енков» указывает на модель образования, типичную для фамилий украинского и южнорусского происхождения. «Миличенков» — это буквально «сын Миличенка», где Миличенко — уменьшительная или патронимическая форма от Милий. Такая цепочка: Милий → Миличенко (маленький Милий или сын Милия) → Миличенков. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, был выходцем с территории современной Украины или южных областей России (Курская, Воронежская, Ростовская губернии), где такие суффиксы в фамилиях особенно распространены.

Есть и менее вероятная, но возможная версия — связь с мирским именем или прозвищем Милич. Миличем могли называть человека, чем-то напоминающего милого, приятного (от общеславянского корня «мил-»). В этом случае фамилия Миличенков — это уже не от Милия, а от Милича, с тем же суффиксом «-енков», означающим принадлежность к роду Милича. Но имя Милий как церковное даёт более надёжную основу, потому что прозвище «Милич» от прилагательного «милый» встречается реже, чем кажется.

Социально фамилия Миличенков, скорее всего, принадлежала крестьянам или однодворцам — так называемому «служилому сословию» южных окраин, которое со временем слилось с крестьянством. Фамилии на «-енков» у них были массовыми, и именно в этой среде сохранились редкие календарные имена вроде Милий. Таким образом, Миличенкова — это фамилия с чёткой географической привязкой к южнорусским и украинским землям, образованная от редкого, но точного имени, и её носители — потомки людей, которые когда-то носили имя Милий или его производные.