Фамилия Милизгинов — редкая и неочевидная для русского уха. Её форма сразу выдает нерусское происхождение основы, но при этом она «одета» в классический русский суффикс принадлежности -ов. Это значит, что предок носителя фамилии звался Милизгин, а его сын или внук стал Милизгиновым. Вопрос упирается в то, что такое «Милизгин».

Скорее всего, перед нами тюркская или кавказская фамилия, адаптированная русской письменностью. Разберем два наиболее вероятных источника.

Первая версия: основа восходит к тюркскому имени или прозвищу, связанному с корнем «мил» (в значении «любимый», «дорогой», от арабского «мил» или персидского «мехр»). В тюркских языках есть имена Мил, Мили, а также сложные формы с суффиксами. Окончание «-изгин» может быть искажением тюркского аффикса принадлежности или местного диалектного слова. Например, в некоторых тюркских языках «изгин» или «ызгын» означает «беглец», «изгнанник», но это скорее натяжка. Более правдоподобно, что Милизгин — это русская передача тюркского Мили-згин, где «згин» — вариант суффикса -оглы/-улы (сын). Тогда Милизгин буквально означает «сын Мили».

Вторая версия: фамилия могла возникнуть на Северном Кавказе, в среде кумыков, ногайцев или балкарцев. Там распространены фамилии на -ов, образованные от личных имен с компонентом «мил» (ср. кумыкские Милиев, Милтаев). Суффикс -гин (-гъин) в некоторых кавказских языках указывает на происхождение или качество. Например, «милизгин» может значить «миловидный», «приятный» — прозвище, данное человеку с мягким характером или приятной внешностью.

Третья, самая слабая версия — искусственное происхождение. В советское время при смене паспортов или записи фамилий со слуха могли возникнуть случайные сочетания. Но для Милизгинова это маловероятно: фамилия слишком структурно цельная.

Словообразовательно фамилия стоит в ряду редких патронимов с нестандартной основой. В отличие от массовых Ивановых или Кузнецовых, Милизгиновы почти наверняка имеют узкую географическую привязку — скорее всего, к одному из регионов Северного Кавказа, Поволжья или Южного Урала, где веками жили тюркские народы. В русских переписных книгах XVII–XVIII веков такая фамилия не встречается; её появление относится к периоду активного включения нерусского населения в общероссийскую систему фамилий (конец XIX — начало XX века).

Таким образом, предок современных Милизгиновых, вероятно, был тюркоязычным человеком по имени Мили или с прозвищем Милизгин. Он не был дворянином и не принадлежал к духовенству — скорее, к крестьянскому или казачьему сословию. Фамилия хранит память о личном качестве или имени основателя рода, но точное значение утрачено вместе с диалектом, из которого её извлекли.