Фамилия Минайленко указывает на происхождение от личного имени Минайло — просторечной, обиходной формы канонического имени Мина. Само имя Мина пришло из греческого языка и переводится как «лунный» или «месячный». В церковном календаре это имя связано с мучеником Миной Калликеладом, пострадавшим за веру около 313 года вместе со святыми Ермогеном и Евграфом; его память отмечают 2 марта.

Мужское имя Мина в прошлом встречалось у русских нередко, но со временем вышло из употребления — почти все мужские имена с окончанием на «-а» оказались вытеснены из обихода. Однако память о нём сохранилась в фамилиях. Форма Минайло возникла как народный вариант имени, а суффикс «-енко», типичный для украинской традиции, добавляет значение «потомок»: Минайленко — буквально «сын Минайла». Такая модель образования фамилий была особенно распространена в левобережной Украине и на юге России, где пересекались русские и украинские антропонимические традиции.

Хотя основа фамилии ясна, стоит упомянуть и редкую альтернативную версию: в некоторых говорах прозвище Минайло могло закрепиться за человеком, чья речь или поведение напоминали что-то «минающее» (от глагола «минать» — проходить, миновать). Но эта гипотеза выглядит искусственной: имя Мина и его производные зафиксированы в святцах, поэтому церковное происхождение фамилии правдоподобнее.

География фамилии прослеживается по архивным записям. В Книге памяти Псковской области упоминается Макар Ефимович Минайленко, родившийся в 1913 году в Донецкой области. В Книге памяти Пермской области есть запись о Петре Ивановиче Минайленко, родившемся в 1893 году в деревне Верхняя Свердловка Донецкой области УССР. Обе записи показывают, что в конце XIX — начале XX века фамилия была устойчиво связана с Донбассом, откуда носители в силу исторических обстоятельств переселялись в разные регионы страны.

Таким образом, фамилия Минайленко — это не просто отсылка к имени, а свидетельство живого народного словообразования: она сохранила форму, которая исчезла из живого употребления, но продолжает звучать в фамильном имени.