Фамилия Минеевы — редкий случай в русском ономастиконе: она не выросла из крестьянского прозвища или ремесла, а была создана искусственно, в семинарской среде. Такие фамилии появлялись, когда будущему церковнослужителю требовалось указать фамилию в документах, а своей у него ещё не было, либо когда природная фамилия (Пьянов, Любовников, Разгуляев) звучала неподобающе для сана. Тогда наставники рекомендовали заменить её на благочестивую, книжную. В основу фамилии легло понятие «минея» — от греческого Menaia, «месячные (книги)». Так называют богослужебные сборники с текстами служб на каждый день месяца, а также книги для чтения, где собраны преимущественно жития святых. Самая известная из них — «Четьи-Минеи», свод житий православных святых. Митрополит Макарий составил Великие Четьи-Минеи, расположив их по дням церковного чествования святых и добавив похвальные и поучительные слова, извлечения из светских сочинений; в этом труде собрана почти вся духовная литература Древней Руси. Позже святой Димитрий Ростовский создал новые Четьи, опираясь и на Великие Четьи-Минеи, и на латинские «Acta sanctorum» болландистов.

Форма фамилии — притяжательное прилагательное с суффиксом -ев: потомок человека, которого в семинарии прозвали Минеем за начитанность или в честь этой книги, становился Минеевым. Однокоренных фамилий мало, и это дополнительно подтверждает искусственное, книжное происхождение: в народной среде основой для фамилии чаще служили имена, профессии или черты характера, а не названия церковных книг.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на столетия, а семинарские фамилии не всегда фиксировались сразу. Но отдельные носители оставили след в документах. В Книгу памяти Республики Башкортостан внесён Минеев Василий Васильевич, родившийся в 1886 году в деревне Шипово Иглинского района. В Книге памяти Омской области упоминается инженер управления Омской железной дороги Минеев Василий Васильевич (р. 1911) из села Липовское Екатеринбургского уезда. Во Владимирской области записан военнослужащий Минеев Василий Васильевич (р. 1906) из села Ефремово Муромского района. Среди известных носителей — Флор Минаич Минеев (?—1700), атаман Донского казачьего войска, участник Азовских походов; советский и российский агрохимик, академик РАСХН Василий Григорьевич Минеев (р. 1931); археолог Михаил Георгиевич Минеев (1956—1993). Фамилия Минеев — памятник славянской письменности, напоминание о том, как церковная книжность влияла на личные имена и фамилии русских людей.