Фамилия Миницер — одна из тех, где интуиция подсказывает немецкое или еврейское происхождение, и интуиция не обманывает. Только вот сразу сказать, от какого именно слова она образована, не получится: здесь возможны два корня, и оба правдоподобны.

Первый и самый вероятный вариант — от немецкого Münzer (через диалектное Münitzer). Так называли чеканщика монет, монетчика или менялу. Слово восходит к Münze — «монета». В немецких землях фамилия Münzer встречается сплошь и рядом, особенно в южных регионах, где были развиты горное дело и монетные дворы. Переселенцы из Германии в Российскую империю в XVIII–XIX веках (в Поволжье, на Украину, в Причерноморье) привезли этот вариант с собой. На русской почве Münzer превратился в Миницер через закономерное смягчение «ц» перед «е» и адаптацию окончания.

Вторая версия — от немецкого Münster, то есть «собор», «монастырь» или название города Мюнстер. В таком случае фамилия Миницер могла указывать на выходца из этого города или на человека, жившего у крупной церкви. Однако против этой версии говорит то, что фамилии от топонимов в немецком языке чаще принимают суффикс -er (Münsterer), а форма Münitzer всё-таки ближе к монетному делу.

Суффикс -ер в немецких фамилиях — типичный показатель профессии или места жительства. В русском языке он остался без изменений, что редкость: обычно немецкие фамилии русифицировали, добавляя -ов или -ин, но Миницер сохранил исходный вид. Это говорит о том, что носители фамилии, скорее всего, сохраняли немецкое самосознание как минимум до конца XIX века.

Кем были предки? Если верна «монетная» версия — ремесленником, работавшим с металлом и деньгами. Если «географическая» — горожанином из западногерманских земель. В любом случае, это фамилия не крестьянская, а городская или цеховая. В Российской империи Миницеры встречались среди обрусевших немцев, реже — среди евреев-ашкеназов (у них тоже встречается вариант Münzer, но чаще в форме Минц). Точную национальную принадлежность первых носителей без генеалогического поиска не установить, но лингвистически фамилия чисто немецкая.