Фамилия Минушин на первый взгляд кажется простой, но её происхождение неочевидно. В отличие от большинства русских фамилий на -ин, образованных от имён или прозвищ на -а/-я (Иван — Иванов, но Иваня — Иванин), основа «Минуш» не является распространённым крестильным именем. Скорее всего, перед нами прозвищное имя, которое давали по внешности, поведению или обстоятельствам.

Самая вероятная версия связывает фамилию с глаголом «минуть» в значении «миновать, обойти, проскользнуть». Прозвище Минуша могли дать человеку уклончивому, избегающему прямых ответов, или тому, кто умел ловко обходить препятствия, а может, и неприятности. В русских говорах слово «минушка» иногда означало «прошлое, былое», что тоже могло стать основой для прозвища — например, для человека, который жил воспоминаниями.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «минуша» — ласковым обращением к ребёнку (от «милый»). В этом случае фамилия образована от домашнего, «семейного» имени, которое впоследствии закрепилось за родом. Такая модель встречается, но реже, чем прозвищная.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Минушин буквально означает «сын Минуши» или «из семьи Минуши». Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. Встречается она нечасто, и её география тяготеет к центральным и северным областям России — там, где сохранились старые говоры с архаичной лексикой. Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких близких родов, а не из множества разрозненных семей.