Фамилия Мирокина — женская форма, парная к мужской Мирокин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Мирока. Такие имена на -ока в русской традиции встречались: Милока, Мирока, Доброка. Корень здесь — мир-, тот же, что в словах «мирный», «мирить», «мировой». В древнерусском языке мир означал не только «отсутствие войны», но и «спокойствие», «согласие», а также «община», «сельское общество». Человек по прозвищу Мирока мог получить его за покладистый нрав или, наоборот, за роль миротворца в спорах.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мирокин сын, то есть «сын Мироки». Такая модель образования — от прозвищ и некалендарных имён на -а, -я — типична для русских фамилий северных и центральных губерний. Формы на -окин, -екин встречаются реже, чем на -ов, но тоже вполне обычны. Фамилия Мирокин (и Мирокина) не входит в число распространённых, её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных гнёзд.

В ономастике существует и другая версия: фамилия могла образоваться от имени Мирон через его просторечную форму Мироха, Мирошка, а затем Мирока. В этом случае Мирокин — вариант более частой фамилии Миронов, но с иным суффиксом. Однако первое объяснение — от самостоятельного прозвища Мирока — выглядит правдоподобнее, поскольку прямое стяжение от Мирон к Мирока нехарактерно для русской антропонимии.

Написание фамилии с одной «к» (Мирокина, а не Мироккина) подтверждает, что основа кончалась на краткий гласный, утраченный при склонении. Никаких дворянских родов с этой фамилией в исторических источниках не зафиксировано — скорее всего, предки носителей Мирокиных были крестьянами или мещанами, жившими в центральной России или на Русском Севере.