Фамилия Миронишен — редкий пример того, как на стыке имени и суффикса рождается неочевидная модель. Если сразу смотреть на окончание -ен, можно решить, что это украинская или белорусская фамилия с суффиксом -енко или -евич, но нет. Здесь работает другая логика: основа Мирониш- и суффикс -ен, который в русской традиции чаще встречается в фамилиях польского или западнорусского происхождения (например, Ковален, Склярен). Однако в данном случае -ен — это не уменьшительный суффикс, а патронимический, то есть указывающий на происхождение от отца.

Корень — Мирон, древнегреческое имя (от μύρον — «мирра, благовонное масло»). В крестьянской среде XIX века имя Мирон было распространено, особенно в южных и центральных губерниях России. От него образовывали множество фамилий: Миронов, Мироненко, Мирончик. Миронишен стоит особняком: в основе лежит не просто имя, а его производная форма Мирониш. Что это за форма? Скорее всего, ласкательное или обиходное прозвище сына Мирона — «Мирониш» (как «Иваниш» от Иван). В некоторых говорах суффикс -иш мог выполнять роль уменьшительно-пренебрежительного, но в фамилиях он чаще закреплялся как указание на родство: «чей? — Миронишев», а потом стянулось в Миронишен.

Географически фамилия привязана к западнорусским и украинским территориям. Встречается в Черниговской, Гомельской, Брянской областях, где смешивались русская, белорусская и украинская антропонимические традиции. Суффикс -ен в таких фамилиях (в отличие от -енко) считается более старым, он фиксирует не «сына Мирона», а «того, кто из рода Мирона», без указания на прямую принадлежность. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные формы на -ен не выделяются в отдельный тип, но встречаются как редкие варианты от имён на -а/-я.

Версия о происхождении от прозвища Мирониш, данного по внешности или поведению (например, «мирониш» — тихоня, скромник), менее вероятна: для прозвищ характерны другие суффиксы (-к-, -ун-, -ай). Так что основная гипотеза — патроним от имени Мирон через промежуточную форму, бытовавшую в локальной традиции.