Фамилия Мишарина образована от имени Мишара — так в старину звали мальчика или мужчину по имени Михаил. В переводе с греческого Михаил значит «богоравный», а Мишара — одна из народных уменьшительных форм этого крестильного имени, вроде Миши или Мишуты. Имя Михаил на Руси почитали особо: в Киеве в его честь возвели Михайловский златоверхий монастырь, да и в целом это одно из самых частых крестильных имён, поэтому и производных от него фамилий много.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мишарина буквально значит «дочь или жена Мишары». Такая модель типична для русских фамилий, которые складывались в XV–XVI веках, когда в среде богатых и служилых людей начало закрепляться наследственное именование. Сначала фамилию получал глава семьи, а уже его потомки — сыновья и внуки — носили её с тем же окончанием. В случае с Мишариной форма на -а, а не на -ин, говорит о женском варианте, но в современном употреблении это просто неизменяемая фамилия, которая досталась и мужчинам, и женщинам.

Интересно, что у фамилии есть и другой возможный источник — прозвище Мишара. В некоторых говорах так могли назвать медлительного, простоватого человека, но эта версия менее правдоподобна: слишком уж очевидна связь с каноническим Михаилом. Редкость формы Мишара, а не привычного Миша, добавляет фамилии колорита: такие варианты чаще встречались в северных и поволжских говорах, где уменьшительные имена дробились на множество местных ласковых форм.

Сравните с однокоренными фамилиями — Мишин, Мишаев, Мишуткин. Все они выросли из одного имени, но каждая закрепила свою ветвь. Мишарина выделяется тем, что сохранила архаичный суффикс -ар-, который сегодня почти не используется в именах, зато осел в фамилиях как память о живой разговорной речи прошлого. Так что носительница фамилии Мишарина может смело считать себя потомком какого-то Мишары — человека, которого в его деревне или городе знали под этим тёплым, домашним именем.