Фамилия Мишонова — женская форма фамилии Мишонов, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель образования здесь редкая: основа Мишон- плюс окончание -а, что типично для фамилий, указывающих на принадлежность к мужу или отцу. Но в русской ономастике суффикс -онов встречается нечасто, чаще мы видим -ов или -ев. Это намекает на то, что корень фамилии не исконно русский, а скорее всего, заимствованный или диалектный.

Самая вероятная версия происхождения — от французского имени Мишон (Michon), уменьшительной формы от Мишель (Michel), то есть от Михаила. В XVIII–XIX веках в России было немало французов, особенно гувернёров, ремесленников и купцов, которые оседали и обрусевали. Фамилия могла закрепиться за потомками такого человека, а суффикс -ов добавили по русской модели, чтобы вписать в местную традицию. Тогда Мишонова означает «принадлежащая Мишону» или «из рода Мишона».

Есть и альтернативная, но менее убедительная версия: от прозвища Мишон, которое могло возникнуть в южнорусских говорах от слова «мишень» или «мишонок» — так иногда называли неуклюжего или медлительного человека. Однако это построение шаткое: в словарях диалектов такое прозвище не фиксируется, а связь с французским именем выглядит естественнее и подтверждается тем, что фамилия Мишонов встречается в дворянских родословных книгах, например, в Курской и Орловской губерниях, где французское влияние было заметно.

Географически фамилия Мишонова распространена неравномерно: чаще всего её носители живут в центральных и южных регионах России, что совпадает с ареалом обрусевших иностранных фамилий. Встречается и вариант с ударением на второй слог (МишОнова), что типично для фамилий с основой на -он. В целом, Мишонова — это фамилия, которая почти наверняка ведёт род от конкретного человека с французскими корнями, а не от общего прозвища или занятия.