Фамилия Мисонис — редкий случай в русском ономастиконе: её основа и суффикс указывают на балтийское, скорее всего, литовское происхождение. Корень mis- связывают с литовским словом misti — «кормиться, питаться», от которого образовано misonė — «пропитание, корм». Таким образом, Мисонис могло быть прозвищем человека, связанного с добычей еды, кормильца, или же того, кто занимался заготовкой кормов. Модель фамилии — суффикс -онис (литов. -onis), который в литовских фамилиях часто указывает на принадлежность к роду или месту: например, Vargonis (от vargonai — орган) или Misonis как «сын того, кто кормит». В русскую среду фамилия попала, вероятно, через миграцию литовцев или белорусов с литовским влиянием в XIX — начале XX века, когда активно записывались фамилии при освобождении крестьян.

Географически Мисонис чаще встречается в западных регионах: Литва, Беларусь, приграничные области России (Псковщина, Смоленщина), а также в среде потомков литовских переселенцев в Сибири. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, форма на -ис — характерный признак литовской ономастики, который не переделывали под русский лад. Встречается и вариант Мисонис с ударением на второй слог, что ближе к литовскому произношению.

Самая правдоподобная версия: предок носителя Мисонис получил прозвище по занятию — кормилец, скотовод или владелец пастбищ. Альтернативная гипотеза, связывающая фамилию с греческим мисон («ненависть»), маловероятна для русского ареала: греческие фамилии на -ис единичны и в основном встречаются на юге, а Мисонис — северо-западная балтийская фамилия. Сословно фамилия не элитарная: она могла принадлежать как крестьянам, так и мещанам, но не дворянам, поскольку в гербовники не попала.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Мисюра, Мисюк, Мисевич — показывает, что основа мис- в балтийских языках дала множество вариантов, но Мисонис сохранил самую архаичную форму, близкую к исходному литовскому слову. Если ваши предки носили эту фамилию, они, скорее всего, происходили из района, где литовский язык был в ходу, и занимались сельским хозяйством.