Фамилия Мисонжникова женская, мужской вариант — Мисонжников. Она принадлежит к распространённому типу русских фамилий с суффиксом -ов/-ев, который указывает на принадлежность: Мисонжников — сын Мисонжника. Основа здесь — слово «мисонжник». Что оно означало?

Скорее всего, «мисонжник» — это профессия или прозвище человека, связанного с мисой (миской). В русских говорах «миса» или «миска» — посуда для еды, иногда так называли и мастера, делавшего миски. Тогда Мисонжник — это ремесленник, токарь или гончар, специализировавшийся на мисках. Возможен и другой вариант: прозвище могли дать человеку, который любил поесть, за его «миску» — то есть за аппетит или пристрастие к обильной пище. В этом случае фамилия отражает бытовую, неофициальную характеристику предка.

Фамилия редкая. Её географическое ядро, по данным современных телефонных справочников и баз, — юг России, в частности Ростовская область, а также Краснодарский край. Встречается она и на Украине. Такая узкая локализация намекает на то, что фамилия могла возникнуть в одной местности, возможно, в среде донских казаков или переселенцев из центральной России, где слово «мисонжник» бытовало активно. Сравните с однокоренными фамилиями: Мисников, Мисникович, Мисюра — все они восходят к той же «мисе», но с разными суффиксами и окончаниями.

Написание с двумя «н» (Мисонжникова, а не Мисонжикова) — не ошибка, а результат словообразования: суффикс -ник- от основы «мисонж» (диалектный вариант «миса» с наращением -онж-). В фамилии сохранился этот полный вариант, что делает её особенно характерной для южнорусского говора.