Фамилия Мисостов — один из тех случаев, когда география бытования подсказывает происхождение точнее, чем морфология. Встречается она преимущественно у адыгских народов (кабардинцев, черкесов), а также у осетин, и это сразу задаёт направление поиска. Основа фамилии — не славянская, а тюркская или кавказская, что делает её редкой для центральной России.

Самый надёжный путь — разбор по тюркско-адыгской модели. Корень «мисос» можно связать с адыгским (черкесским) словом «мысэ» (в некоторых диалектах — «мис») — «овца», или с тюркским «мис» (медь). Суффикс «-ов» — чисто русский патронимический формант, который добавили при интеграции в российскую имперскую систему фамилий. То есть исходное имя или прозвище Мисост (Мисос) могло означать «медный» (по цвету волос или по ремеслу медника) или «овцевод» — что для кавказского скотовода логично. В адыгской традиции такие прозвища часто закреплялись за родом.

Есть и более редкая версия: что фамилия восходит к кабардинскому княжескому роду Мисостовых. В исторических источниках XIX века упоминаются Мисостовы среди уорков (дворян) Кабарды. Если это так, то фамилия — не просто прозвище, а указание на принадлежность к военно-феодальному сословию. Окончание «-ов» здесь — поздняя русификация, а исконная форма, скорее всего, звучала как Мисосте или Мисосты.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: редкое сочетание адыгского корня с русским суффиксом. В отличие от массовых крестьянских фамилий на -ов, которые просто указывали на отца (Иван — Иванов), Мисостов — результат межкультурного контакта, когда кавказское родовое имя адаптировали под имперские стандарты. Носители фамилии, вероятно, происходят из адыгской диаспоры, рассеянной после Кавказской войны, или из осетинских селений, где эта фамилия тоже закрепилась.

Точной даты возникновения фамилии назвать нельзя, но ясно, что она старше середины XIX века, когда началась массовая фиксация фамилий у горских народов.