Фамилия Мистициана — редкая и необычная для русского ономастикона. Сразу бросается в глаза её основа: слово «мистицизм» (от греч. mystikos — тайный, скрытый), обозначающее религиозно-философское учение о возможности непосредственного общения человека с божеством. Однако фамилия образована не от этого книжного понятия напрямую, а, скорее всего, от прозвища Мистициан. Такое прозвище мог получить человек, склонный к мистическим размышлениям, мечтатель, чудак, которого в деревне считали «не от мира сего». В крестьянской среде, где ценились практичность и труд, подобное прозвище давали редко и с оттенком иронии.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна для русской традиции. Обычные суффиксы притяжательных фамилий (-ов, -ин, -ский) здесь отсутствуют. Окончание -а указывает на то, что фамилия, скорее всего, искусственная или передана в форме женского рода (как, например, у украинских фамилий на -а). Возможно, она принадлежала семинаристу или выходцу из духовного сословия, которому при поступлении в училище дали «говорящую» фамилию по характеру или увлечению. В среде семинаристов было принято образовывать фамилии от латинских и греческих корней, и Мистициана могла стать калькой с латинского mysticus.

Географически фамилия почти не встречается в исторических документах. Единичные упоминания можно найти в южнорусских и украинских губерниях, где влияние польской и униатской традиций давало больше простора для книжных и отвлечённых фамилий. В отличие от массовых фамилий-ремесел или отчеств, Мистициана — это штучный антропоним, который не мог возникнуть в среде простых крестьян или посадских людей. Её носитель почти наверняка был грамотным человеком, возможно, священником, учителем или приказным.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мистицкий, Мистич) показывает, что Мистициана — самая редкая и «книжная» форма. Если Мистицкий мог быть образован от топонима, то Мистициана прямо отсылает к понятию «мистика». Споров о происхождении здесь почти нет: основа прозрачна, а необычный суффикс и окончание выдают искусственное, кабинетное происхождение. Это не фамилия рода, а скорее личное прозвище, закреплённое в документах за одним человеком.