Фамилия Митрофаненко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Митрофан. Фамилия Митрофанов происходит от имени Митрофан (в переводе с латинского - «слава матери», «найденный матерью», «матерью явленный»). Считалось, что на младенца, крещеного под этим именем, снисходит Божественная благодать. Яростно защищал свою православную веру от еретиков. Прожил очень долгую и насыщенную событиями жизнь. Скорее всего,‭ ‬основатель рода‭ Митрофаненко ‬был выходцем из высшего сословия.‭ ‬Такое предположение объясняется тем,‭ ‬что фамилии,‭ ‬образованные от полной формы имени,‭ ‬имела в основном социальная верхушка,‭ ‬знать,‭ ‬или семьи,‭ ‬пользовавшиеся в данной местности большим авторитетом,‭ ‬представителей которых соседи уважительно звали полным именем,‭ ‬в отличие от других сословий,‭ ‬звавшихся,‭ ‬как правило,‭ ‬уменьшительными,‭ ‬производными,‭ ‬обиходными именами.‭ Вероятнее всего, образование фамилии Митрофаненко началось приблизительно в XIV веке, что обусловлено историческими процессами. Поэтому Митрофаненко буквально понималось как «сын Митрофана».