Фамилия Мизайлец — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычного русского суффикса -ов или -ин, зато есть характерный для западных и южных славянских земель суффикс -ец. Он часто указывал на принадлежность человека к какому-то месту или на его характерную черту. Поэтому первое, что приходит на ум: Мизайлец — это выходец из населённого пункта с названием вроде Мизайлы, Мизайлов или Мизайлево. Такие топонимы могли существовать на территории современной Украины, Беларуси или Польши, где фамилии с этим суффиксом особенно часты.

Основа фамилии — «Мизайл» — не имеет очевидного славянского корня. Скорее всего, это форма личного имени. Здесь возможны две версии. Первая: искажённое произношение библейского имени Михаил. В некоторых говорах, особенно под влиянием польского или украинского языков, «Михаил» могло звучать как «Михал» или «Мизгал», а оттуда уже до «Мизайла» — один шаг. Вторая версия: это вариант имени Мисаил (также библейского происхождения, встречается в Ветхом Завете). Имя Мисаил в народной речи могли переделать в более привычное «Мизайл», а потом и в фамилию.

Суффикс -ец в таких фамилиях часто выполнял роль патронимического или локативного показателя. Если Мизайл — имя отца, то Мизайлец — это «сын Мизайла». Если же это название деревни, то человек, пришедший из неё, получал прозвище Мизайлец. Учитывая, что фамилии на -ец в основном закрепились за крестьянством и мещанством (особенно на западе Российской империи), носитель этой фамилии с высокой вероятностью принадлежал к этим сословиям. Аристократических родов с таким окончанием почти не бывает.

Географически фамилия Мизайлец, скорее всего, привязана к западным регионам современной Украины (Волынь, Подолье) или югу Беларуси. Там подобные модели фамилий (Ковалец, Григорец, Иванец) — обычное дело. В центральной России она почти не встречается, что подтверждает её западнорусское или малороссийское происхождение.

В написании фамилии возможны варианты: Мизайлец, Мизойлец или даже Мизгалец, если в основе лежал глагол «мизгать» (щуриться, плохо видеть). Однако версия с именем выглядит более убедительной, так как даёт прямую и ясную модель образования: от крестильного имени через прибавление суффикса.