Фамилия Мижитова — женская форма фамилии Мижитов. Её основа — личное имя Мижит, которое в тюркских и монгольских языках восходит к арабскому «маджид» (ماجد) — «славный», «благородный». В бурятском, калмыцком и тувинском именослове это имя известно в формах Мижит, Мажит, Мажид. Суффикс -ов (в женском варианте -ова) — стандартный русский патронимический формант, который получили фамилии многих народов Российской империи при переходе к официальной записи в метриках и переписях.

Географически фамилия Мижитова чаще всего встречается в Бурятии, Забайкальском крае и Иркутской области, реже — в Калмыкии и Туве. Это указывает на бурятское или монгольское происхождение: в бурятском языке имя Мижит не редкость, а фамилии на -ов(а) активно закреплялись за бурятами в XIX — начале XX века, когда их начали массово записывать по русскому образцу.

Есть и другая версия, менее вероятная, но упоминаемая: Мижит могло быть прозвищем от тюркского «мыжыт» или «мижит» — так в некоторых сибирских говорах называли нерасторопного, медлительного человека. Однако для бурятской и монгольской среды первично именно имя арабского происхождения, пришедшее через исламскую культуру и закрепившееся в буддийских регионах.

Однокоренные фамилии — Мижитов, Мижитовский, Мажитов — встречаются у башкир и татар, что подтверждает общий корень «маджид». У бурят же форма Мижитова — одна из самых распространённых женских фамилий с этим корнем.

Сословная принадлежность носителей фамилии не прослеживается: среди Мижитовых были и крестьяне-скотоводы, и буддийские священнослужители, и советские учителя. Фамилия не указывает на аристократическое происхождение, но и не была крестьянской в уничижительном смысле — она просто фиксирует имя предка, которого звали Мижит.