Фамилия Мизоян — яркий пример армянской модели фамилий на -ян, что значит «из рода кого-то». Это самый распространённый суффикс в армянской ономастике, который заменяет древние патронимические окончания. В основе фамилии лежит личное имя Мизо, которое, скорее всего, является сокращённой или диалектной формой какого-то более полного имени. В армянской традиции такие усечённые формы (например, Мкртич → Мко) были обычным делом в быту. Таким образом, Мизоян — это потомок человека по имени Мизо.

С корнем слова сложнее. В армянском языке нет прямого слова «мизо» со значением профессии или предмета. Можно предположить, что имя Мизо восходит к арабскому или тюркскому заимствованию, но это лишь гипотеза. Более правдоподобно, что это вариант имени Мисак (арм. Միսաք) или Миша, которые в народном произношении дали форму Мизо. В любом случае, фамилия указывает на родовую принадлежность, а не на занятие предка.

Географически фамилия Мизоян распространена в основном среди армян, в том числе и в диаспоре. В самой Армении она встречается в областях Ширак и Арагацотн, а также в Ереване. Поскольку фамилия не относится к числу самых массовых (как Арутюнян или Саркисян), её носители, вероятно, происходят из одной или нескольких близких родовых линий, закрепившихся в определённом регионе. Социальный статус предков определить по фамилии невозможно — армянские фамилии на -ян носили и крестьяне, и ремесленники, и духовенство.

С точки зрения написания, фамилия стабильна: в русском языке пишется через «о» (Мизоян), в армянском — Միզոյան. Варианты с «а» (Мизаян) или с удвоенной «з» (Миззоян) ошибочны и встречаются только из-за искажений при записи. В отличие от многих русских фамилий, у Мизоян нет женской или мужской формы — она склоняется как существительное мужского рода, но в быту её часто не склоняют, что тоже норма для фамилий этого типа.