Фамилия Мизунов — один из тех случаев, когда за привычным звучанием скрывается неочевидная, но живая история, уходящая корнями в диалектную лексику. Вопреки возможной догадке, её основа — не «мизун» как имя или прозвище, а глагол «мизуть» или «мизунить», который в ряде русских говоров означал «шалить, проказничать, делать что-то исподтишка». Человек, получивший прозвище Мизун, скорее всего, был озорником или хитрецом, склонным к мелким пакостям. Модель образования типична для восточнославянских фамилий: к основе на твёрдый согласный прибавился патронимический суффикс -ов, превративший прозвище в наследственное имя рода.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с такой фамилией в Архангельской и Вологодской губерниях, что косвенно подтверждает севернорусское происхождение глагола «мизуть». Интересно, что в тех же краях бытовало слово «мизюра» — так называли плаксу или капризного ребёнка. Возможно, прозвища Мизун и Мизюра имели один корень, но разошлись по значению: первый — про шалуна, второй — про нытика.

Словообразовательный суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась не позднее XVII века, когда отчества на -ов стали закрепляться как наследственные. Раньше Мизунов мог писаться и как Мизуновъ, с твёрдым знаком на конце, что встречается в метрических книгах XIX века. Вариант с ударением на второй слог — Мизу́нов — более распространён, хотя в некоторых семьях старожилов можно услышать ударение на первый, что выдаёт диалектную основу.

Редкость фамилии делает её своеобразным маркером: если вы встретили Мизунова за пределами традиционного ареала, велика вероятность, что его предки — выходцы из тех же северных или вологодских земель. В отличие от фамилий, образованных от церковных имён (Иванов, Петров), Мизунов — чисто прозвищная, бытовая, что говорит о незнатном происхождении носителей: скорее всего, это были крестьяне или ремесленники, чьё прозвище закрепилось в документах при переписях.