Фамилия Моголенец — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа и суффикс указывают на украинское или белорусское происхождение, а корень уводит в историю тюркских народов и средневековую географию.

Разбираем по частям. Суффикс -ец в восточнославянских фамилиях часто обозначал принадлежность к местности или этнической группе: «выходец оттуда-то» (ср. Полтавец, Черниговец, Турчинец). В данном случае основа Могол- — это искажённое «могол» (или «мугол»). В русских документах XVI–XVII веков так называли монголов, а точнее — выходцев из Монгольской империи или потомков Золотой Орды. В более узком смысле «моголами» на Руси могли называть татарских мурз и служилых людей «татарского» происхождения, которые переходили на русскую службу.

Таким образом, Моголенец — это, скорее всего, прозвище, превратившееся в фамилию. Его дали человеку, которого считали похожим на «могола» (смуглый, черноволосый, с восточными чертами лица) либо который имел реальную родословную связь с татарскими родами. Вторая версия — топонимическая: существовали селения с названиями вроде Моголь, Моголино, Моголевка (особенно на территории современной Украины и Беларуси, куда в XV–XVII веках переселялись татарские служилые люди). Житель такого села получал прозвище Моголенец, а потом и фамилию.

Версия о связи с империей Великих Моголов в Индии маловероятна: прямых контактов у русских крестьян с ней не было, а книжное слово «могол» в этом значении вошло в обиход поздно и не могло стать массовым прозвищем.

Фамилия встречается в основном в западных регионах бывшей Российской империи: в Черниговской, Киевской, Могилёвской губерниях, а также у потомков переселенцев на Кубани и в Сибири. В списках казачьих и крестьянских родов она нередка, что говорит о недворянском, простонародном происхождении.

Итог: Моголенец — фамилия-потомок этнического или топонимического прозвища, связанного с тюрко-монгольским миром. Предок носителя мог быть выходцем из татарской среды, служилым человеком «литовского» или «черкасского» разряда, либо просто получить прозвище за внешность.