Фамилия Молитвина — женская форма, а её мужской вариант Молитвин. С первого взгляда корень «молитв-» наталкивает на мысль о церковной лексике, но не всё так прямолинейно. В русской ономастике фамилии, образованные от слова «молитва», встречаются, но чаще в виде Молитвинов или Молитвенных. Суффикс -ин указывает на притяжательное значение: чей? — Молитвин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Молитва.

Самая правдоподобная версия: Молитвой в старину могли прозвать набожного человека, который часто и подолгу молился, возможно, даже ходил в паломники или был церковным чтецом. Однако есть и другая, более редкая гипотеза: в некоторых говорах «молитва» могла означать не только обращение к Богу, но и просьбу, челобитную, даже заклинание. Тогда прозвище могло закрепиться за человеком, который постоянно о чём-то просил, клянчил или, наоборот, был известен как умелый заступник, «молитвенник» за других.

Географически фамилия Молитвин (и Молитвина) тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается в старых переписях Вологодской, Костромской и Вятской губерний, где была сильна традиция давать прозвища по личным качествам и бытовому поведению. В этих краях фамилия не была дворянской или купеческой — скорее крестьянской или мещанской, что подтверждается её редкой частотностью в родословных книгах.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Молитвин отличается от Молитвенных (суффикс -ских/-ских, типичный для южнорусских и украинских фамилий) и от Молитвинова (более полная форма, как бы «отчества»). Короткая форма на -ин говорит о том, что прозвище Молитва дали одному конкретному предку, и оно закрепилось за его потомками без дополнительных наращений. В современном написании фамилия сохранила букву «и» в корне, хотя в диалектах могла звучать как «Малатвин» — но это уже следы аканья, а не иной этимологии.

Таким образом, носительница фамилии Молитвина, скорее всего, происходит из семьи, где предка выделяли за его благочестие или, реже, за назойливую просьбу. Никакой мистики или тайного масонского подтекста — просто прозвище, данное по заметной черте поведения, и суффикс, превративший его в родовое имя.