Фамилия Монолдорова — редкая, и её разбор начинается не с корня, а с необычного суффиксального оформления. На слух она кажется тюркской или кавказской, но словообразовательная модель выдает русскую адаптацию: суффикс -ов- (в женском роде -ова) типичен для русских фамилий, образованных от полных форм прозвищ или имен. Основа же — «Монолдор» — явно не славянская. Скорее всего, это прозвище, заимствованное из тюркских языков, где «монол» или «монолдо» может означать «одноглазый» (от «мон» — один, «көз» — глаз). В казахском, киргизском и других языках слово «монолдор» или «монолдур» встречается как прозвище для человека с одним глазом или для того, кто носит повязку на глазу. В русской среде такое прозвище могли дать переселенцу из Средней Азии или местному жителю с заметной особенностью, а затем закрепить в фамилии по отчеству: сын Монолдора — Монолдоров.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключенная: основа могла восходить к сложному имени или титулу. В некоторых тюркских диалектах «монол» — это «мудрец» или «наставник» (ср. монгольское «монол» — «вечный»), а «дор» — искаженное «тор» или «тур» («стоять», «быть»). Тогда Монолдор — прозвище вроде «вечный страж» или «постоянный советник». Однако в ономастике такие конструкции редки, и первая версия — с «одноглазым» — опирается на большее число реальных параллелей (фамилии вроде Кривозубов, Косоглазов, Одноглазов).

Географически фамилия Монолдорова почти не встречается в центральных областях России. Основные носители, судя по единичным записям, сосредоточены в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах, где в XIX веке активно селились татары, башкиры, казахи и другие тюркоязычные группы. Фамилия могла возникнуть в среде крещеных татар или уральских казаков, контактировавших с кочевниками. Суффикс -ов- указывает, что её носители скорее всего были государственными крестьянами или казаками, а не дворянами (у тех преобладали фамилии на -ский).

Примечательно, что фамилия сохранила женскую форму Монолдорова как основную в документах (мужская — Монолдоров). В русской традиции это не редкость, но для тюркской основы — показатель полной ассимиляции. Если сравнивать с однокоренными, то ближайшие аналоги — Монолов, Монолдин — встречаются чаще, но все равно остаются штучными. Таким образом, фамилия Монолдорова — это, скорее всего, прозвище по физической особенности, прошедшее через русскую фамильную модель и закрепившееся в зоне этнического контакта.