Фамилия Мосежная — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить привычную модель «имя + суффикс принадлежности» и присмотреться к суффиксу -жн-. В русских фамилиях он встречается редко и почти всегда указывает на топонимическое происхождение: фамилия образована от названия места через прилагательное.

Скорее всего, основа Мосеж- восходит к названию реки, деревни или урочища. В русском языке есть гидроним Мосега (приток Волги в Тверской области) и несколько деревень Мосеево, Мосеевка. Если допустить, что в говорах или старых записях форма могла звучать как Мосежа (сравните: Онега — Онежский), то житель такой местности получал прозвище «Мосежный» — то есть «с Мосеги, из Мосежи». Суффикс -жн- здесь выполняет ту же роль, что и в фамилиях Онежский, Волжский, Заонежский.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с личным именем Мосей (народная форма от Моисей). Тогда Мосежный могло означать «сын Мосея» или «человек Мосея». Но для отчества в русской традиции типичны суффиксы -ов/-ев или -ин (Мосеев, Мосейкин). Суффикс -жн- для патронимической модели нетипичен, поэтому топонимическое объяснение выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к Северо-Западу России — к Тверской, Новгородской, Вологодской областям. Именно там встречаются реки и селения с корнем Мос-/Моз- (Мосега, Мосеево, Мосеевский). В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Мосега, но фамилия Мосежная, вероятно, оформилась позже — при переходе прозвища по наследству или при переписях XIX века.

Написание фамилии могло колебаться: в старых записях встречается Мосежной, Мосежный, Мосежная (по роду). Современная форма с окончанием -ая закрепилась в женском роде, но как фамилия она не склоняется по родам — носитель может быть и мужчиной, и женщиной.