Фамилия Мовшенков образована от прозвища или имени Мовша — это разговорная форма древнееврейского имени Моше (Моисей). В среде еврейского населения черты оседлости Российской империи имя Моше часто трансформировалось в Мовша, Мовш, Мовша́, а от него уже пошли фамилии с типичными для восточнославянской ономастики суффиксами.

Суффикс -енков тут примечателен. Он характерен для украинской и южнорусской (в основном курско-орловской) модели образования фамилий, где -енко/-енков указывает на «сына такого-то». Мовшенков — буквально «сын Мовши». Если бы фамилия возникла в центральной России, мы бы увидели Мовшин, а если в Беларуси или Польше — Мовшевич. Форма на -енков чётко локализует фамилию на территории современной Украины или южных областей России (бывшая Слобожанщина, Черниговщина, Полтавщина), где в XVIII–XIX веках активно шёл процесс приписки фамилий еврейскому населению.

Поскольку имя Мовша было широко распространено, фамилия не указывает на конкретное занятие предка — только на его отца. Но социальный контекст важен: в большинстве случаев носители фамилии Мовшенков происходили из мещан или купцов, реже — из ремесленников. Дворянских корней у фамилии нет: в «Общем гербовнике» она не значится, а среди потомственных дворян Российской империи Мовшенковы не встречаются.

Встречаются варианты написания с одной «н» — Мовшенов, но это скорее результат ошибки при записи или адаптации в иноязычной среде. Фамилия редкая, не входит даже в сотню самых частых еврейских фамилий бывшей империи, поэтому её носители — это, как правило, потомки одной или нескольких семей из конкретного местечка или города.