Фамилия Мринина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В отличие от большинства русских фамилий, она не заканчивается на -ов, -ев или -ин, а имеет окончание -ина, что характерно для притяжательных прилагательных женского рода. Однако в данном случае это не фамилия женщины, а исходная форма фамилии, закрепившаяся за родом. Такой тип фамилий встречается в северных и центральных областях России, где суффикс -ин был распространён шире, чем на юге.

Корень «Мрин-» почти не встречается в современном русском языке. Самая вероятная версия — связь с диалектным словом «мрына» или «мрина», которое в некоторых говорах означало «хмурый, угрюмый человек» или «ворчун». В словаре В. И. Даля зафиксировано слово «мрындать» — бродить без дела, скучать. Отсюда прозвище Мрыня могли дать человеку с меланхоличным характером или тому, кто любил бродить один. Фамилия Мринина образована от такой основы через суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Мринин, то есть сын или потомок Мрыни.

Менее вероятная, но возможная версия — искажение фамилии Мрынина при переписи или в документах. В русских говорах звук «ы» после «р» иногда заменялся на «и» (сравните «крыло» и диалектное «крило»). Так Мрынина могла стать Мрининой. Также нельзя исключать, что основа восходит к уменьшительной форме крестильного имени, например, Дмитрий (в народе — Митря, Митроха, где «Мр-» могло появиться как вариант редукции). Но эта гипотеза слабее — нет прямых параллелей в других фамилиях.

География фамилии узкая. Судя по открытым данным, Мринины встречаются в основном в Центральной России, единично — на Урале. Фамилия не относится к дворянским или купеческим; её носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Разбор фамилии показывает, что перед нами типичная «прозвищная» фамилия, где характеристика человека стала родовым именем.