Фамилия Муфазанов — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская или арабо-тюркская, а русским в ней является только суффикс -ов. Разбирать её стоит с конца: суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от имени или прозвища отца, то есть «сын Муфазана». Основа Муфазан — это и есть ключ к происхождению.

Самое правдоподобное объяснение: Муфазан — это адаптированная форма арабского имени Муфаддаль (аль-Муфаддаль), что значит «превосходный», «предпочтительный», «избранный». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, арабские имена часто меняли звучание: «дд» упрощалось до «з» или «с», а ударный слог смещался. Так имя Муфаддаль могло превратиться в Муфазан. Фамилия, образованная от такого имени, типична для потомков татарских мурз, башкирской знати или выходцев из Средней Азии, которые переходили на русскую службу и получали фамилии по отцу.

Вторая, менее вероятная версия связывает основу с тюркским словом «муфаза» (пустыня, безлюдное место) — тогда прозвище Муфазан мог получить человек, живший в степи или в отдалённом селении. Но против этого говорит то, что в тюркских языках слово «муфаза» не образует личных имён, а фамилии на -ов от прозвищ обычно вытесняли более старые именные формы.

Географически фамилия Муфазанов встречается в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в местах традиционного расселения татар и башкир. В дореволюционных документах, например в метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний, изредка попадаются записи о Муфазановых среди государственных крестьян и отставных солдат. В дворянских родословных книгах эта фамилия не числится — скорее всего, её носители были выходцами из податных сословий, получившими фамилию при переходе в православие или при переписях.

Словообразовательно фамилия стоит в одном ряду с такими же редкими фамилиями тюркского происхождения, как Абузаров, Мусагалиев, Мухаметзянов. Все они построены по одной схеме: арабо-тюркское имя плюс русский патронимический суффикс. Фамилия Муфазанов не получила широкого распространения и осталась локальной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска в конкретных регионах.