Фамилия Мугульдинов — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем попытка разобрать корень «на слух». Если отбросить интуитивное желание связать её с монгольскими «мугулами» (искажённое «могол»), то реальная картина оказывается прозаичнее и локальнее.

Основной ареал фамилии — Казахстан и прилегающие регионы России (Оренбургская, Астраханская области). Строится она по стандартной русской модели: основа + суффикс -ин. Но здесь суффикс указывает не на принадлежность отцу (как в фамилиях на -ов), а на прозвище, которое закрепилось за конкретным человеком. Основа «Мугульдин» — это либо искажённое тюркское имя, либо прозвище.

Самая правдоподобная версия: Мугульдинов восходит к казахскому слову «мұғалім» (учитель, наставник). В русских документах XIX века, при переписях и записи в метрические книги, тюркское «мұғалім» нередко записывали на слух как «мугульдин» или «мугальдин». Прибавление фамильного суффикса -ин дало «Мугульдинов» — буквально «сын того, кого звали Учителем». Это типичная история для фамилий, образованных от социального статуса или профессии, хотя в данном случае прозвище могло быть дано не по роду занятий, а как уважительное обращение к грамотному или религиозному человеку.

Менее вероятно, но стоит упомянуть: в некоторых говорах «мугуль» означало «круглый, полный», а суффикс -дин мог быть остатком тюркского аффикса принадлежности. Но эта версия не имеет серьёзной опоры в ономастике.

Фамилия не дворянская, не старинная боярская — она возникла не раньше середины XIX века, когда начался массовый учёт населения в степных областях. Носители её — потомки казахов или татар, перешедших на русскую фамильную модель, но сохранивших в основе тюркское слово. Сейчас фамилия встречается редко, даже в Казахстане, и чаще всего в форме «Мұғалдинов» или «Мугальдинов». Вариант с «г» — результат канцелярской ошибки или диалектного произношения, закрепившийся в документах.