Фамилия Мухаббатова — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа не славянская и не тюркская (как у большинства «восточных» фамилий на -ов), а арабско-персидская. Слово «мухаббат» (محبت) в переводе с арабского означает «любовь», «привязанность», «дружба». В персидском и тюркских языках, испытавших сильное арабское влияние, это слово вошло в обиход как личное имя Махаббат или Мухаббат, особенно распространённое в Таджикистане, Узбекистане и среди кавказских народов (например, у лезгин).

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Мухаббат- добавился суффикс -ов, а затем типичное женское окончание -а. Формально это «дочь/жена Мухаббата». Однако в русской традиции фамилии на -ов становились наследственными и передавались по мужской линии, так что Мухаббатова — это фамилия потомков человека, которого в метриках или быту записали как Мухаббат. Интересно, что в советское время, при паспортизации народов Средней Азии, многие личные имена без фамилий были русифицированы именно таким образом: к имени отца прибавляли русский суффикс, и получалась фамилия для всей семьи.

С географической точки зрения, фамилия Мухаббатова почти наверняка имеет корни в Центральной Азии, вероятнее всего в Таджикистане или Узбекистане, где имя Махаббат/Мухаббат встречается и у мужчин, и у женщин. В России эта фамилия крайне редка; её носители — потомки мигрантов из этих регионов или смешанные семьи. Сословной привязки нет: в отличие от дворянских фамилий на -ский, такие патронимы не указывают на знатность, а просто фиксируют факт рождения в среде, где русская фамильная система наложилась на восточный именник.

Если допустить менее вероятную версию, можно вспомнить, что в арабском языке «мухаббат» — это ещё и форма женского рода от «мухибб» (любящий). Но в качестве фамилии это не меняет сути: предок носителя или носительницы был человеком, которого окружающие знали как «Любовь» или «Любимый». В русском контексте аналогия — фамилия Любимов, но с той разницей, что Мухаббатова напрямую отсылает к восточной культуре и исламской традиции имён.