Фамилия Мухаметкул — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркское имя сохранилось почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. Её основа — арабско-тюркское составное имя Мухамметкул (варианты: Мухаметкул, Мухаммадкул). Первая часть — Мухаммет (араб. Мухаммад — «восхваляемый», имя пророка), вторая — кул (тюрк. «раб, слуга»). В целом имя означает «раб Мухаммада» или «слуга Пророка» — распространённая модель в исламской антропонимии, где «кул» указывает на религиозную преданность, а не на социальный статус раба.

Фамилия не прошла через стандартную русификацию, что говорит о её позднем закреплении. В России фамилии такого типа — без суффикса — обычно получали татары, башкиры и представители других тюркских народов, принявшие фамилии в XIX–XX веках, когда переписчики фиксировали имя отца или родовое имя в исходной форме. Если бы фамилия оформлялась по русской модели раньше, она звучала бы как Мухаметкулов или Мухаметкулин. Отсутствие суффикса — маркер того, что носитель или его предки жили в среде, где русская грамматика не доминировала (например, в башкирских или татарских деревнях, где фамилии записывали со слов).

Географически фамилия тяготеет к Башкортостану, Татарстану и Оренбуржью. Встречается также у казахов и узбеков, но в русскоязычной записи. Учитывая, что имя Мухамметкул было популярно у башкир и татар в XVII–XVIII веках, предки носителя фамилии с высокой вероятностью были мусульманами-суннитами, возможно, из сословия тептярей или государственных крестьян. Среди дворянских родов фамилия не зафиксирована — это фамилия простого сельского населения.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что сохранила арабский определённый артикль (в имени Мухаммад) и тюркский аффикс принадлежности, слитые в одно слово. В русском языке она склоняется как существительное мужского рода второго склонения (Мухаметкула, Мухаметкулу), но в бытовой речи носители часто не склоняют её, что характерно для фамилий восточного происхождения.