Фамилия Мухамидярова — женская форма от Мухамидяров, а та, в свою очередь, — типичный патроним на -ов, образованный от арабо-мусульманского имени Мухамидяр. Это сложносоставное имя, в котором первая часть — «Мухаммад» (араб. «восхваляемый», «прославляемый», имя пророка ислама), а вторая — «яр» (от персидского «друг», «близкий», «товарищ»). В буквальном прочтении Мухамидяр означает «друг Мухаммада» или «близкий к Пророку».

Такая модель образования имён (арабское имя + персидский компонент «яр») была распространена у тюркских и финно-угорских народов, исповедовавших ислам, особенно у татар и башкир. Встречаются параллельные варианты: Мухаммадьяр, Мухаметьяр, Мухаммедьяр — всё это вариации одного имени, различающиеся по диалектному произношению и записи в метриках. Фамилия Мухамидярова, таким образом, укажет на то, что предок по мужской линии носил это имя, а фамилия закрепилась за его потомками.

Суффикс -ов в данном случае стандартный для русской патронимической модели, который в Поволжье и Приуралье наслаивался на татарские и башкирские фамилии в процессе делопроизводства Российской империи. В самой татарской среде фамилия могла бы выглядеть как Мухамидяров (без дополнительной русификации), но в русскоязычных документах форма с -ов стала нормой. Географически фамилия наиболее характерна для Татарстана, Башкортостана и Оренбургской области, где фиксируются целые гнёзда однофамильцев.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В татарском произношении оно чаще падает на последний слог (Мухамидяро́ва), в русском бытовом — может смещаться на третий с конца (Мухамидя́рова). Это типичный признак фамилий, живущих на стыке двух языковых систем. Сословно предки Мухамидяровых могли быть как крестьянами, так и торговцами или духовными лицами — имя «друг Пророка» давали не по социальному статусу, а по религиозному настрою семьи.