Фамилия Мухатжанов — самобытный памятник восточной культуры, который чаще всего воспринимается как фонетический вариант более старой формы Мухатджанов. Чтобы понять её значение, нужно разобрать составное тюркское имя, от которого она произошла.

В основе лежит мужское имя Мухатджан. Оно состоит из двух частей. Первая — Мухат, диалектная и упрощённая форма арабского имени Мухаммет (Мухаммад), которое переводится как «восхваляемый» или «прославляемый». Вторая часть — «джан», в тюркских языках означающая «душа», «дух» или «жизнь». В составе имён этот элемент выполняет роль ласкательного обращения, выражая близость и любовь. Поэтому буквально имя Мухатджан переводится как «душа Мухаммета» или, в более свободной трактовке, «дорогой, как душа».

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к имени Мухатджан добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к отцу. Таким образом, потомок человека по имени Мухатджан со временем получил фамилию Мухатджанов. В устной речи сочетание звуков «тдж» оказалось неудобным для произношения, поэтому произошло упрощение: звук «д» выпал, и форма закрепилась как Мухатжанов. Это типичный пример фонетической адаптации восточного имени в русскоязычной среде.

Стоит оговориться, что процесс формирования фамилий у тюркских народов был длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Фамилия могла закрепиться в разных регионах независимо, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте её появления можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований. Сама же фамилия, вне зависимости от конкретной ветви рода, остаётся замечательным памятником, соединившим в себе арабскую религиозную традицию и тюркскую эмоциональную окраску имени.