Фамилия Мухитдинова образована от имени Мухитдин. Оно является одним из диалектных вариантов арабского мужского имени Мухутдин (Мухетдин), которое состоит из двух компонентов: «мохет» - «возрождающий, укрепляющий» и «дин» - «вера, религия». Таким образом, имя Мухитдин можно перевести как «возрождающий, укрепляющий, защищающий религию». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мухитдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.