Фамилия Мухяров — редкий случай, когда основа ясна, а способ её появления в русском языке неочевиден. Корень здесь — тюркское слово «мухяр» (или «мухйар»), которое в разных диалектах означает «избранный», «лучший», «предводитель». В османском и азербайджанском контексте это титул выборного старшины, главы общины или городского головы. То есть прозвище Мухяр давали человеку, занимавшему выборную должность, либо уважаемому старейшине, которого избирали для решения общих дел.

Словообразовательная модель фамилии — русский патронимический суффикс -ов, который присоединили к тюркской основе. Это указывает на то, что фамилия сформировалась в среде, где русская административная культура накладывалась на местные традиции: скорее всего, в Поволжье, на Урале или в Западной Сибири, среди татар, башкир или других тюркских народов, которые в XVII–XIX веках получали фамилии по отцу через русские шаблоны. Если бы фамилия осталась в чисто тюркской среде, она звучала бы как Мухяров — без суффикса, а просто Мухяр.

Ударение в фамилии, вероятно, падает на второй слог: Мухя́ров. Это типично для фамилий, где суффикс -ов присоединён к трёхсложной основе тюркского происхождения. Встречается написание через «е» — Мухеров, но вариант через «я» фиксирует произношение, близкое к исходному тюркскому «йа».

В отличие от более частых фамилий на тюркской основе (Тимеров, Ахметов), Мухяров не связан с профессией ремесленника или природным объектом. Его социальный подтекст — статусный. Предок носителя фамилии был не просто уважаемым человеком, а тем, кого выбрали для управления: сельским старостой, выборным судьёй или представителем общины перед властями. В дореволюционной переписи эта фамилия могла бы встречаться среди крестьян-башкир или татар-мишарей, у которых сохранялись элементы самоуправления.

Ономастических справочников, где подробно разбиралась бы фамилия Мухяров, нет — она достаточно редкая. Но по аналогии с фамилией Мухтаров (от «мухтар» — тоже «избранный») можно уверенно говорить, что корень восходит к арабскому через тюркское посредничество, а не к славянским или финно-угорским языкам.