Фамилия Мукимбекова — тюркская по происхождению, с ярко выраженной патронимической (по отцу) структурой. Она образована по модели «личное имя + титул/звание + притяжательный аффикс». Основа фамилии — имя Мукимбек, где «Муким» — арабское имя (от «муким» — «постоянный, пребывающий, оседлый»), а «бек» — древний тюркский титул, означающий «господин», «князь», «правитель». Таким образом, имя Мукимбек буквально значит «оседлый господин» или «постоянный правитель», что могло указывать на владельца земли, живущего на одном месте в отличие от кочевой знати.

Словообразовательный суффикс -ова в русской записи — это адаптация тюркской притяжательной формы. В оригинале фамилия звучит как Мукимбекова, где конечный гласный -а — это женский род в русской грамматике. Мужской вариант — Мукимбеков. Фамилию получили потомки человека по имени Мукимбек, скорее всего, в XIX–XX веках, когда в Средней Азии и Казахстане шёл массовый процесс закрепления фамилий по русскому образцу.

Титул «бек» в составе фамилии — маркер социального положения предка. В дореволюционной Средней Азии и среди казахов беками называли представителей привилегированного сословия, часто — старшин родов или мелких владетелей. Однако сама фамилия Мукимбекова не обязательно свидетельствует о знатности рода в момент её записи: «бек» могло стать частью личного имени (как, например, у башкир или татар), а не указанием на реальный титул. Тем не менее, наличие этого компонента говорит о том, что предок носителя фамилии был заметной фигурой в своей общине.

Географически фамилия Мукимбекова распространена в Узбекистане, Казахстане, Кыргызстане и среди тюркоязычных народов России (особенно у казахов и узбеков). Встречаемость её невысокая — это редкая фамилия, что типично для имён с конкретным, не массовым корнем. Родственные фамилии — Мукимов (без титула), Бекмукимов (перестановка частей) — встречаются чаще, но Мукимбекова сохранила более архаичную и полную форму.

Если отталкиваться от семантики, предок-основатель мог быть человеком, который держал землю, не кочевал, либо получил имя как прозвище за постоянство и надёжность. Точных письменных источников о конкретном носителе имени Мукимбек нет, но модель фамилии однозначно указывает на её происхождение из среды тюркской аристократии или зажиточных крестьян, принявших русскую форму фамилии в период имперской или советской паспортизации.